截至2018年末，南通市拥有普通高等学校8所，年末在校学生10.68万人；成人高校2所，在校学生2.12万人；中等职业教育学校28所，在校学生7.48万人；普通高中43所，在校学生7.78万人；普通初中163所，在校学生16.32万人；小学324所，在校学生34.62万人；特殊教育学校7所，在校学生0.15万人；各级各类幼儿园508所，在园儿童17.67万人。